北京大学第六医院门诊设有普通门诊、专家门诊、特需门诊、中西医结合门诊、神经内科门诊、多专家会诊以满足不同层次、不同问题患者的就诊需求;还设有进食障碍、成瘾行为、睡眠障碍、记忆障碍、行为分析治 疗、精神疾病康复咨询、心理、老年儿童等相关专业门诊，以满足就诊者对专科或特殊方向的咨询和治 疗需求。
在精神药理学研究领域，药理研究室结合基础与临床资源，开展精神疾病的新药研发、病理机制及其临床学研究工作。在情感障碍研究方向，采用先进的分子遗传学、神经生物学、精神药理学及功能影像学等技术或理论，对情感障碍进行系列开拓性研究，并取得重要成果。
北大六院于2003年开始建立无抽搐电休克室，经过了十多年的发展，已经成为我院的重点科室之一，迄今为止，已经完成5万人次患者的，取得很好的效果。我院拥有一支具有丰富临床经验的MECT团队，包括：科主任1名，副主任医师1名，主治医师2名，麻醉科医师2名，主管护师2名，护师1名，护士1名。我院拥有世界一 流的仪器设备。
虽然目前医学上对抑郁症已有行之有效的治 疗办法，但全球只有不足一半的患者（据世界卫生组织的数据，在一些国家中仅有不到10%的患者）接受有效治 疗。而影响有效治 疗的因素有：缺乏资源，缺乏训练有素的卫生保健人员，以及社会对精神疾患的歧视等。